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ETIOLOGIE

CLADE PLANTEN

phylum chlorophyta groenwieren

klasse trebouxiophyceae

orde chlorellales

¨  familie chlorellaceae

   

CLADE DIEREN

phylum arthropoda

klasse insecta

Orde phtyraptera (luizen)

   

¨  familie philopteridae, bijtende luizen

   

¨  familie gyropidae(suborder, bijtende luizen

 

 

¨   familie trimenoponidae, bijtende luizen

 

 

¨  Familie gyropidae, bijtende luizen

 

 

¨  familie trichodectidae, bijtende luizen

 

 

 

 
   

 

 
   

¨  familie phtiridae, steek en zuigluizen

   

 

 

¨  familie hematopinidae, steek en zuigluizen

   
   

 

 

 

 
   

Orde hemiptera (halfvleugeligen)

¨  Familie cimicidae (wantsen)

   
   

¨  familie reduviidae

   

Orde diptera

¨  familie tabanidae

   
   

¨  familie muscidae

   
   
   
   

¨  familie braulidae

   

¨  familie scathophagidae

   

 

 

¨  familie calliphoridae

 

 

¨  familie glossinidae

   

¨  familie hippoboscidae

   

 

 

¨  familie oestridae (horzels)

   
     

 

     
       

¨  Familie simuliidae (kriebelmuggen)

   

¨  familie culicidae (muggen)

   
   

¨  Familie ceratopogonidae (zandvliegen)

 

 

¨  Familie psychodidae (motmuggen)

   

orde hymenoptera (vliesvleugeligen)

¨  Familie vespidae

   

 

 

Orde siphonaptera (vlooien)

¨  Familie pulicidae

   
   

orde lepidoptera

¨  Familie notodontideae

   

orde coleoptera

¨  Familie Nitidulidae

   

KLASSE ARACHNIDA (SPINNEN)

   

 

 

 

KLASSE ACARI (MIJTEN)

Orde astigmata

¨  Familie falculiferidae

 

 

¨  Familie analgidae

   

¨  Familie dermoglyphidae

   

Orde mesostigmata

¨  Familie dermanyssidae

   

¨  Familie rhinonyssidae

   

¨  Familie Laelapidae

   

¨  Familie varroidae

 

 

 

 

Orde thrombidiformes

¨  Familie tarsonemidae

   

¨  Familie thrombiculidae

   

¨  familie cheyletidae

   
   
   

Orde sarcoptiformes

¨  familie psoroptidae

   

¨  Familie sarcoptidae

   

¨  familie acaridae

   

Orde ixodidae (teken)        

   

¨  Familie argasidae

 

 

¨  Familie ixodidae

   

Orde prostigmata

¨  Familie demodicidae

   
   
   

KLASSE CRUSTACEA

Orde cyclopoida (copepoda)

¨  Familie lernaeidae

   

Orde arguloïda

¨  Familie argulidae

   

Orde porocephalida

¨  Familie linguatulidae

   

phylum annelida

Orde rhynchobdellinda

¨  Familie piscicolidae

     

phylum nematoda 

Orde ascaridida

¨  Familie toxocaridae

   

¨  Familie ascarididae

   

¨  Familie oxyuridae

   
   
   

¨  Familie toxocaridae

   

¨  Familie dioctophymatidae

   

Orde spirurida

¨  familie filariidae

   

¨  familie onchocercidae

     
     
   
   
   
       

¨  familie spiruridae

   
   

¨  Famillie thelaziidae

 

 

¨  Familie camallanidae

   

¨  Familie habronematidae

   

Orde strongylida

¨  Familie dictyocaulidae

 

 
   

¨  Familie metastrongylidae

   
   
   

¨  Familie trichostrongylidae

 

 

 

 

¨  Familie ankylostomatidae

   
   
   

 

 

¨  Familie strongylidae

   

¨  Familie strongyloïdae

   

¨  Familie syngamidae

     
     

¨  Familie protostrongylidae

   
   

Orde trichocephalida

¨  Familie capillariidae

   
   
   

¨  Familie trichuridae

   
   
   

orde camallanida

¨  familie dracunculidae

   

phylum plathelminthes

klasse cestoda

orde pseudophyllidea

¨  familie diphyllobothriideae

   

Orde cyclophyllidae

¨  Familie taeniidae

   

¨  familie mesocestoïdeae

     
   

¨  familie hymenolepididae

   

¨  familie anoplocephalidae

   

Klasse trematoda

orde strigeatida

¨  familie schistosomatidae

   

Orde monopisthocotylea

¨  Familie gyrodactylidae

     

¨  Familie dactylogyridae

     

Orde echinostomida

¨  Familie fasciolidae

   
   

¨  familie paramphistomatidae

   
   

Orde plagiorchiida

¨  Familie dicrocoeliidae

   

 

 

Klasse turbellaria

 

 

phylum chordata

klasse sauropsida

Orde squamata  - serpentes

Systematiek: domein: procaryota – rijk: bacteria

 

CLADE BACTERIEN

Phylum Acidobacteria

Class Acidobacteria

Acidobacteriales Cavalier-Smith 2002

Class Holophagae

Acanthopleuribacterales Fukunaga et al. 2008

Holophagales Fukunaga et al. 2008

Class Solibacteres

"Solibacterales"

"Bryobacterales"

Phylum Actinobacteria

Class Acidimicrobiia

Acidimicrobiales Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009

Class Actinobacteria

Acidothermales Sen et al. 2014

"Catenulisporales" Donadio et al 2012

"Streptomycetales" Kampfer 2012

Geodermatophilales Sen et al. 2014

Frankiales Sen et al. 2014

Nakamurellales Sen et al. 2014

"Kineosporiales" Kampfer 2012

orde micrococcales [Actinomycetales; Bifidobacteriales; Arthrobacteria]

¨  Familie Bifidobacteriaceae

Genres Aeriscardovia, Bifidobacterium, Gardnerella et Parascardovia

¨  Familie Actinomycetaceae

¨  Genus Actinobaculum
¨  Genus Actinomyces
   

 

 
¨  Genus trueperella (Arcanobacterium)

 

 

¨  Famille des Microbacteriaceae

Genres Microbacterium et Rathayibacter

¨  familie micrococcaceae

Genres Arthrobacter, Micrococcus, Renibacterium, Rothia, Stomatococcus

¨  GENUS MICROCOCCUS
   
   

¨  Famille des Dermatophilaceae

¨  GenUS Dermatophilus
   

¨  familie corynebacteriaceae

¨  genus corynebacterium: Gram + staaf met gezwollen uiteinde
   

¨  familie mycobacteriaceae

¨  genus mycobacterium; zuurresistente kiemen      

 

 

¨  Famillie nocardiaceae

   
¨  Genus Rhodococcus
   

orde Propionibacteriales" Patrick & McDowell 2012

¨  Famille des Propionibacteriaceae

¨  Genus Propionibacterium

"Streptosporangiales" Goodfellow 2012

"Jiangellales" Tang et al. 2012

"Glycomycetales" Labeda 2012

"Micromonosporales" Genilloud 2012 [Actinoplanales]

"Pseudonocardiales" Labeda & Goodfellow 2012

"Corynebacteriales" Goodfellow & Jones 2012 [Mycobacteria]

Class Coriobacteriia

Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013

Eggerthellales Gupta et al. 2013

Class Nitriliruptoria

Egibacterales Zhang et al. 2015

Egicoccales Zhang et al. 2015

Euzebyales Kurahashi et al. 2010

Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009

Class Rubrobacteria

Rubrobacterales Rainey et al. 1997

Class Thermoleophilia

Gaiellales Albuquerque et al. 2012

Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009

Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009

Phylum Aquificae[edit]

Class Aquificae

Aquificales Reysenbach 2002 emend. Gupta & Lali 2013

Desulfurobacteriales Gupta & Lali 2014

Phylum Armatimonadetes[edit]

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Armatimonadetes.

Class Armatimonadia

Armatimonadales Tamaki et al. 2011

Class Chthonomonadetes

Chthonomonadales Lee et al. 2011

Class Fimbriimonadia

Fimbriimonadales Im et al. 2012

Phylum Bacteroidetes

Class Bacteroidia

Ordre des Bacteroidales Krieg 2012

¨  Familie Bacteroidaceae

¨  Genus Bacteroides

 

 

¨  Familie Porphyromonadaceae

Genre Porphyromonas

Class Balneolia

Balneolales Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016

Class Chitinophagia

"Chitinophagales" Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016

Class Cytophagia

Cytophagales Leadbetter 1974

Class Flavobacteriia

Orde Flavobacteriales Bernardet 2012

¨  Familie Flavobacteriaceae

Genus Arenibacter, Bergeyella, Bizonia, Capnocytophaga, Chryseobacterium, Coenonia, Elizabethkingia, Flavobacterium, Leeuwenhoekiella, Ornithobacterium, Riemerella, Salegentibacter, Tenacibaculum et Weeksella. Gram negatieve bacteriën

 

 

Class Rhodothermia

Rhodothermales Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016

Class Sphingobacteriia

Sphingobacteriales Kämpfer 2012

Phylum Chlamydiae

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chlamydiae.

Class Chlamydiae

Orde Chlamydiales Storz & Page 1971 emend. Everett et al. 1999

Orde chlamydiales

¨  Familie Chlamydiaceae

¨  Genus Chlamydia

 

 

¨  Genus Chlamydiophila

deze classificatie in twee genera: chlamydia en chlamydiophyla werd recent verlaten, en werd enkel het genus chlamydia weerhouden. (532)

   

Phylum Chlorobi

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chlorobi.

Class Chlorobia

Chlorobiales Gibbons & Murray 1978

Class Ignavibacteria

Ignavibacteriales Iino et al. 2010

Phylum Chloroflexi

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chloroflexi.

Class Anaerolineae

Anaerolineales Yamada et al. 2006

Class Ardenticatenia

Ardenticatenales Kawaichi et al. 2013

Class Caldilineae

Caldilineales Yamada et al. 2006

Class Chloroflexia

Chloroflexales Gupta et al. 2013

Herpetosiphonales Gupta et al. 2013

Kallotenuales Cole et al. 2013

Class Dehalococcoidia

Dehalococcoidales Löffler et al. 2013

Class Ktedobacteria

Ktedobacterales corrig. Cavaletti et al. 2007 emend. Yabe et al. 2010

Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011

Class Thermomicrobia

Sphaerobacterales Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997

Thermomicrobiales Garrity & Holt 2002

Class Thermoflexia

Thermoflexales Dodsworth et al. 2014

Phylum Chrysiogenetes

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chrysiogenetes.

Class Chrysiogenetes

Chrysiogenales Garrity & Holt 2002

Phylum Cyanobacteria

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Cyanobacteria.

Class Gloeobacteria

Gloeobacterales Cavalier-Smith 2002

Class Phycobacteria

Chroococcidiopsidales

Chroococcales Cavalier-Smith 2002

Nostocales [Stigonematales]

Oscillatoriales

Pleurocapsales

Pseudanabenales

Spirulinales

Synechococcales

Phylum Deferribacteres

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Deferribacteres.

Class Deferribacteres

Deferribacterales Huber & Stetter 2002

Phylum Deinococcus-Thermus

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Deinococcus-Thermus.

Class Deinococci

Deinococcales Rainey et al. 1997 (radio-resistant micrococci)

Thermales Rainey & da Costa 2002

Phylum Dictyoglomi

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Dictyoglomi.

Class Dictyoglomi

Dictyoglomales Patel 2012

Phylum Elusimicrobia

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Elusimicrobia.

Class "Blastocatellia"

"Blastocatellales" Pascual et al. 2015

Class Elusimicrobia

Elusimicrobiales Geissinger et al. 2010

Class "Endomicrobia"

"Endomicrobiales" Zheng et al. 2016

Phylum Fibrobacteres

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Fibrobacteres.

Class "Chitinispirillia"

"Chitinispirillales" Sorokin et al. 2016

Class Chitinivibrionia

Chitinivibrionales Sorokin et al. 2014

Class Fibrobacteres

"Fibromonadales" Abdul Rahman et al. 2016

Fibrobacterales Spain et al. 2012

Phylum Firmicutes

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Firmicutes.

Class Erysipelotrichia

Eggerthiales

Erysipelotrichales Ludwig et al. 2010

Class Negativicutes

Selenomonadales Marchandin et al. 2010

Class Thermolithobacteria

Thermolithobacterales

Class Tissierellia

Tissierelliales

Class Bacilli

Orde Bacillales

ORDE BACILLALES

¨  Familie Bacillaceae

¨  Genus Bacillus
   

¨  Familie paenibacIllaceae

   

¨  Familie Listeriaceae

   

¨  Familie staphylococcaceae

Genus Gemella, Jeotgalicoccus, Macrococcus et Staphylococcus

¨  Genus staphylococcus
   

Haloplasmatales

Lactobacillales Ludwig et al. 2010

ORDE LACTOBACILLIALES

¨  Familie Aerococcaceae

Genres Abiotrophia, Aerococcus, Allofustis, Dolosicoccus, Eremococcus, Facklamia, Globicatella et Ignavigranum

¨  Familie Enterococcaceae

Genres Atopobacter, Enterococcus, Melissococcus et Vagococcus

   

¨  FamilIe Lactobacillaceae

Genre Lactobacillus

¨  FamilIe Leuconostocaceae

Genres Leuconostoc et Weissella

¨  FamiIle Streptococcaceae

Genres Lactococcus et Streptococcus

   

Class Clostridia

ORDE CLOSTRIDIALES

¨  Familie Clostridiaceae

   

Genus fecalibacterium                                                                                  

Genus hespellia                                                                                            

Genus guggenheimella                                                                                

Genus sarcina                                                                                              

¨  Familie Eubacteriaceae

Genus Eubacterium

Orde Halanaerobiales Rainey and Zhilina 1995

Natranaerobiales

Thermoanaerobacteriales Wiegel 2010

Class Mollicutes

Acholeplasmatales

Anaeroplasmatales

ORDE ANAEROPLASMATALES

¨  Famille des Erysipelotrichaceae

¨  Genus Erysipelothrix
   

Orde Entomoplasmatales Tully et al. 1993

ORDE MYCOPLASMATALES

¨  Familie Mycoplasmataceae

Genus Eperythrozoon, Haemobartonella, Mycoplasma et Ureaplasma

Synoniem pleuropneumonia like organisms, PPLO/ Ultrafiltreerbare organismen (100-200nm) bestaande uit RNA en DNA, kunnen in milieukcultuur gekweekt worden

   

Phylum Fusobacteria

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Fusobacteria.

Class Fusobacteria

Fusobacterales

ORDE FUSOBACTERIALES

Staley & Whitman 2012

¨  Famillie fusobacteriaceae

¨  Genus : Fusobacterium en Streptobacillus

   

Phylum Gemmatimonadetes

Class Gemmatimonadetes

Gemmatimonadales Zhang et al. 2003

Class Longimicrobia

Longimicrobiales Pascual et al. 2016

Phylum Lentisphaerae

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Lentisphaerae.

Class Lentisphaeria

Lentisphaerales Cho et al. 2004 emend. Choi et al. 2013

Victivallales Cho et al. 2004

Class Oligosphaeria

Oligosphaerales Qiu et al. 2013

Phylum Nitrospirae

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Nitrospirae.

Class Nitrospiria

"Nitrospirales"

Phylum Planctomycetes

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Planctomycetes.

Class Phycisphaerae

Phycisphaerales Fukunaga et al. 2010

Tepidisphaerales Kovaleva et al. 2015

Class "Planctomycetia"

"Brocadiales" Jetten et al. 2011

Planctomycetales Schlesner & Stackebrandt 1987 emend. Ward 2011

Phylum Proteobacteria

klasse alfaproteobacteria

Orde Caulobacterales

Orde Holosporales

Orde "Kopriimonadales" Kwon et al. 2005c

Orde Kordiimonadales Kwon et al. 2005

Orde Magnetococcales Bazylinski et al. 2013

Orde "Pelagibacterales" Grote et al. 2012

ORDE DER RHIZOBIALES

Systematiek: stam: proteobacteria - klasse: alfa proteobacteria

 

¨  FAMILIE BARTONELLACEAE    

¨  GENUS BARTONELLA       
   

¨  Familie Brucellaceae        

¨  Genus Ochrobacterium  
¨  Genus Brucella     
   

Orde Rhodobacterales [Parvularculales]

Orde Rhodospirillales

Orde Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014

ORDE RICKETTSIALES

¨  Familie rickettsiaceae

¨  Genus orienta, rickettsia, chlamydia
   

¨  Familie anaplasmataceae

genus Anaplasma, Aegyptianella, Cowdria, Ehrlichia, Neorickettsia et Wolbachia

¨  genus ehrlichia
   
¨  Genus anaplasma

 

 
¨  Genus cowdria
   
¨  Genus aegyptianella
   

Orde Sphingomonadales

Orde Sneathiellales

klasse Betaproteobacteria

ORDE BURKHOLDERIALES

¨  Famillie Alcaligenaceae

Genus Alcaligenes, Bordetella, Brackiella, Pelistega, Sutterella,Taylorella

   

Orde "Ferritrophicales" Weiss et al. 2007

Orde "Ferrovales" Johnson, Hallberg & Hedrich 2014

Orde "Gallionellales" Weiss et al. 2007 (iron bacteria)

Orde Hydrogenophilales Garrity, Bell & Lilburn 2006

Orde Methylophilales Garrity, Bell & Lilburn 2006

Ordre des Neisseriales

¨  Famille des Neisseriaceae

Genres Chromobacterium, Laribacter, Neisseria et Uruburuella

NEISSERIA: diplokokken

   

Orde Nitrosomonadales

Orde Procabacteriales Garrity, Bell & Lilburn 2003

Orde Rhodocyclales Garrity, Bell & Lilburn 2006

Orde Sulfuricellales Watanabe, Kojima & Fukui 2015

klasse gammaproteobacteria

Orde Acidiferrobacterales Kojima, Shinohara & Fukui 2015

Orde Acidithiobacillales

Orde aeromonadales

¨  Famillie aeromonadaceae

Genus Aeromonas

   

Orde Alteromonadales

Orde Arenicellales Teramoto, Yagyu & Nishijima 2015

ORDE CARDIOBACTERIALES

Garrity, Bell & Lilburn

¨  FAMILIE CARDIOBACTERIACEAE         

¨  GENUS DICHELOBACTER 
   

Orde Cellvibrionales Spring et al. 2015

Orde Chromatiales

Orde enterobacteriales

¨  Familie enterobacteriaceae

Gram negatieve kiemen. Genus : Buttiauxella, Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Escherichia, Hafnia, Klebsiella (incluant le genre Calymmatobacterium), Moellerella, Morganella, Plesiomonas, Proteus, Providencia, Raoultella, Salmonella, Serratia, Shigella, Trabulsiella et Yersinia.

¨  Genus edwardsiella        

 

 
¨  Genus escherichia
   
¨  Genus salmonella
   
¨  GENUS SHIGELLA
   
¨  GENUS PROTEUS
   
¨  GENUS YERSINIA
   
¨  GENUS KLEBSIELLA

Gram – diplobacil

 

ORDE LEGIONELLALES

¨  familie legionellaceae

¨  genus legionella
   

¨  Familie Coxiellaceae

Genus Coxiella is een gram negatieve kiem

 
   

Orde Methylococcales

Orde Oceanospirillales

Orde Orbales Kwong & Moran 2013

ORDE PASTEURELLALES

¨  Familie pasteurellaceae

Genus : Actinobacillus, Avibacterium, Gallibacterium, Haemophilus, Histophilus, Lonepinella, Mannheimia, Nicoletella, Pasteurella, Phocoenobacter et Volucribacter

Genus pasteurella

 

 
¨  Genus avibacterium
   
¨  genus actinobacillus«
   
¨  Genus haemophilus
   

ORDE PSEUDOMONADALES

¨  Famillie Pseudomonadaceae

¨  GENUS PSEUDOMONAS
   

 

 

¨  Famillie Moraxellaceae

 

 

¨  Genus  Acinetobacter

 

 
¨  Genus Moraxella
¨  Genre Marinomonas
¨  Genus Psychrobacter

Orde Salinisphaerales

ORDE THIOTRICHALES

¨  FAMILIE FRANCISELLACEAE

¨  Genus FRANCISELLA
   

ORDE VIBRIONALES

¨  Famillie Vibrionaceae

Genus Enterovibrio, Grimontia, Photobacterium et Vibrio

   

ORDE DER XANTOMONADALES

¨  Familie Xanthomonadaceae

Genus Schineria et Stenotrophomonas

klasse Deltaproteobacteria

Orde Bdellovibrionales

Orde Bradymonadales Wang et al. 2015

Orde Desulfarculales

Orde Desulfobacterales

ORDE DESULFOVIBRIONALES

¨  Familie der desulfovibrionaceae

¨  Genus lawsonia
   

Orde Desulfurellales

Orde Desulfuromonadales

Orde Myxococcales (fruiting gliding bacteria)

Orde Oligoflexales Nakai et al. 2014

Orde Syntrophobacterales

klasse Epsilonproteobacteria

Orde Campylobacterales

Ordre des Campylobacterales

¨  Famille des Campylobacteraceae

Genus Arcobacter en Campylobacter

   

¨  Famillie Helicobacteraceae

¨  Genus Helicobacter:soortspecifiek en orgaanspecifiek (maag)
   

Orde Nautiliales

Phylum "Spirochaetia"

Class Spirochaetes[edit]

Orde Brachyspirales corrig. Gupta et al. 2014

Orde Brevinematales Gupta et al. 2014

Orde Leptospirales Gupta et al. 2014

ORDE SPIROCHETALES  Buchanan 1917 emend. Gupta et al. 2013

¨  Familie Spirochaetaceae

Genus Borrelia, Brevinema, Spirochaeta et Treponema

¨  genus Borrelia
   
¨  Genus treponema
   

¨  Familie Serpulinaceae       

¨  Genus Brachyspira      

 

 

¨  Familie Leptospiraceae

¨  Genus Leptospira
   

Phylum Synergistetes

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Synergistetes.

Class Synergistia

Synergistales Jumas-Bilak et al. 2009

Phylum Thermodesulfobacteria

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Thermodesulfobacteria.

Class Thermodesulfobacteria

Thermodesulfobacteriales Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002

Phylum Thermotogae

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Thermotogae.

Class Thermotogae

Kosmotogales Bhandari & Gupta 2014

"Mesoaciditogales

Petrotogales Bhandari & Gupta 2014

Thermotogales Reysenbach 2002 emend. Bhandari & Gupta 2014

Phylum Verrucomicrobia

This section lists the orders of Bacteria within the phylum Verrucomicrobia.

"Methylacidiphilales" Op den Camp 2009

Class "Spartobacteria"

"Chthoniobacterales" Sangwan et al. 2004

"Xiphinematobacterales"

Class Opitutae

Opitutales Choo et al. 2007

Puniceicoccales Choo et al. 2007

Class Verrucomicrobiae

Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 emend. Yoon et al. 2008

List of Candidate Phyla[edit]

"Gracilibacteria" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum GN02)

"Saccharibacteria" Albertsen et al. 2013 (Candidate phylum TM7)

"Microgenomates" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP11)

"Parcubacteria" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OD1)

"Aegiribacteria" Hamilton et al. 2016

"Kryptonia" Castelle 2013

"Zixibacteria" Castelle 2013

"Cloacimonetes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum WWE1)

"Latescibacteria" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum WS3)

"Marinimicrobia" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum SAR406; candidate phylum Marine Group A)

"Omnitrophica" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP3)

"Aminicenantes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP8)

"Calescamantes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum EM19)

"Atribacteria" Dodsworth et al. 2013 (Candidate phylum OP9)

"Hydrogenedentes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum NKB19)

"Poribacteria" Fiesler et al. 2004

"Aerophobetes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum CD12; BHI80-139)

"Abawacabacteria" Anantharaman et al. 2016

"Berkelbacteria" Wrighton et al. 2014 (Candidate phylum ACD58)

"Caldiserica" Mori et al. 2009

Acetothermia Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP1)

Endoecteinascidia

Tectomicrobia Wilson et al. 2014

Fervidibacteria Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OctSpa1-106)

"Peregrinibacteria" Brown et al. 2015 (Candidate phylum PER)

"Coatesbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Dadabacteria" Hug et al. 2016

"Deinonema" Ludwig W et al. 1990

"Delongbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Desantisbacteria" Probst et al. 2016

"Doudnabacteria" Anantharaman et al. 2016

"Edwardsbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Eisenbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Firestonebacteria" Anantharaman et al. 2016

"Fischerbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Fraserbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Glassbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Handelsmanbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Kapabacteria" Kantor et al. 2015

"Lindowbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Margulisbacteria" Anantharaman et al. 2016

Modulibacteria (Candidate phylum KSB3)

"Nitrospinae" Lucker et al. 2013

"Raymondbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Riflebacteria" Anantharaman et al. 2016

"Rokubacteria" Hug et al. 2016

"Schekmanbacteria" Anantharaman et al. 2016

Dependentiae Yeoh et al. 2016 (Candidate phylum TM6)

"Wallbacteria" Anantharaman et al. 2016

"Wirthbacteria" Hug et al. 2016

DOMEIN FUNGI (MYCOSES) myc

Phylum Microsporidia

Orde apansporoblastina

¨  Fam unicaryonidae

¨  Genus encephalitozoon
   
     
       

Orde Dissociodihaplophasida

¨  Familie nosematidae

   

Phylum Chytridiomycota

espèces aquatiques dont les spores portent un flagelle. On les considère comme les ancêtres de tous les autres champignons.

Klasse Chytridiomycetes

ORDE CHYTRIDIALES

¨  Genus Chytridium

ORDE RHIZOPYDIALES

¨  Genus Batrachochytrium
   

Phylum Ascomycota

les spores sont produites à l'intérieur de sacs (les asques) et sont projetées, à maturité, à l'extérieur par ouverture de l'asque.

klasse dothideomycetes

orde pleosporales

   

¨  familie pleosporaceae

   

orde capnodiales

¨  familie davidiellaceae

   

 

 

klasse leoteomycetes

orde heliotales

¨  familie myxotrichaceae

   

Klasse Ascomycetes

orde incertae sedis

   

Orde onygenales

¨  Familie Onygenaceae

¨  Genus Histoplasma
   

 Klasse Eurotiomycetes

orde onygenales

¨  familie onygenaceae

¨  Genus coccidioïdes
   

¨  familie ajellomycetaceae

   

¨  familie arthrodermataceae

 

 

Orde ASCOSPHAERALES

¨  Familie ASCOSPHAERACEAE

¨  Genus asCOSPHAERA
   

orde eurotiales

¨  Familie Trichocomaceae

¨  Genus aspergillus
   
¨  genus penicillium
   

klasse sordariomycetes

orde microascales

   

orde ophiostomatales

¨  familie ophiostomataceae

   

orde Hypocreales

¨  familie nectriaceae

   

¨  familie clavicipitaceae

   

Klasse Saccharomycetes

Orde saccharomycetales

¨  Familie saccharomycetaceae

¨  Genus candida
   

klasse incertae sedis

orde incertae sedis

¨  familie incertae sedis

   

Phylum Zygomycota

espèces à spores non flagellées dont les cellules ne sont pas séparées par des cloisons.

klasse zygomycetes

Orde mucorales

¨  Familie mucoraceae

¨  Genus mucor

 

 

Phylum Basidiomycota

les spores se développent à l'extrémité de cellules spécialisées (les basides) et sont dispersées par le vent à maturité.

orde malasseziales

¨  familie malasseziaceae

   
   

orde corticiales

¨  familie corticiaceae

   

Klasse Urediniomycetes

Orde sporidiales

¨  Familie Sporidiobolaceae

¨  Genus Cryptococcus (Filobasidiella)
   

Phylum oomycota

Klasse oomycetes

Orde saprolegniales

¨  Familie saprolegniaceae

   

¨  Familie leptolegniaceae

   

phylum choanozoa

deze kiemen situeren zich op de grens tussen dier en fungi

klasse ichthyosporea

orde dermocystida

   
   

Phylum Glomeromycota

autrefois classés dans les Zycomycota ils sont maintenant considérés comme constituant une division à part.

nota: de mycotoxines

overschrijden van de maximale norm: fusarium (trichotecene 5ppm, zearaleone 0,5ppm, fumonisine 50ppm); alternaria ( alternarol toxine 2ppm); claviceps purpurea (ergotoxine 2ppm); aspergillus flavus (aflatoxine 20ppm); penicillium (patuline, ochratoxine A, citrinine, paxiline)

DOMEIN VIRUSSEN

virussen

Groep I – DNA virus met dubbele streng

¨  FamilIe Myoviridae – exemple phage T4
¨  FamilIe Podoviridae
¨  FamilIe Siphoviridae
¨  FamilIe Ascoviridae
¨  Familie Adenoviridae
   
¨  FamilIe Asfiviridae
   
¨  FamilIe Baculoviridae
¨  FamilIe Corticoviridae
¨  FamilIe Fuselloviridae
¨  FamilIe Guttaviridae
¨  Familie Herpesviridae
   
¨  Familie iridoviridae
   
     
¨  Familie lipothrixviridae
¨  Familie nimaviridae
¨  Familie papovavirus
   
   
   

 

 

 

 
   
   
   
¨  FamilIe Phycodnaviridae
¨  FamilIe Plasmaviridae
¨  Familie poxviridae
   
   
¨  FamilIe Rudiviridae
¨  Famille des Tectiviridae

Genres non classés

Mimivirus – exemple Acanthamoeba polyphaga mimivirus

Groep II - DNA virus met enkelvoudige streng

(Groupe II – Virus à ADN à simple brin)

¨  bactériophageN (NIET GECLASSEERD)
¨  FamilIe Inoviridae
¨  FamilIe Microviridae
¨  niet geclasseerde VirusSEN
¨  FamilIe Geminiviridae
¨  FamilIe Nanoviridae
¨  familie circoviridae
   
¨  Famille des Parvoviridae

 

 

Genres non classés: Anellovirus – exemple Torque teno virus

Groep III RNA virus dubbele streng 

(Groupe III - Virus à ARN à double brin)

¨  Familie Birnaviridae
   
¨  Familie Chrysoviridae
¨  Familie Cystoviridae
¨  Familie hypoviridae
¨  Familie Partitiviridae
¨  Familie Reoviridae       

Rotavirus, orthoreovirus

 

 
¨  FamilIe Totiviridae
  • · Genres non classés
  • · Endornavirus – exemple Vicia faba endornavirus

Groep IV – RNA virus enkelvoudige streng met positieve polariteit

(Groupe IV – virus à ARN simple brin à polarité positive (Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)

¨  Ordre Nidovirales (Virus "nidifiés")

¨  Familie arteriviridae

   

¨  Familie coronaviridae

   

¨  FamilIe Roniviridae

¨  FamilIe Astroviridae

¨  FamilIe Barnaviridae

¨  FamilIe Bromoviridae

¨  Familie caliciviridae

   

¨  Famille des Closteroviridae

¨  Famille des Comoviridae

¨  Familie flaviviridae

   

¨  FamilIe Flexiviridae

¨  FamilIe Hepeviridae - exemple virus de l'hépatite E

¨  FamilIe Leviviridae

¨  FamilIe Luteoviridae

¨  FamilIe Narnaviridae - virus à ARN nus

¨  FamilIe Nodaviridae

   

¨  FamilIe Potyviridae

¨  FamilIe Sequiviridae

¨  FamilIe Tetraviridae

¨  Familie togaviridae

   

¨  Famille des Tombusviridae

¨  Famille des Tymoviridae

Genres non classés

Genre Benyvirus – exemple Beet necrotic yellow vein virus

Genre Cheravirus – exemple Cherry rasp leaf virus

Genre Furovirus – exemple Soil-borne wheat mosaic virus

Genre Hordeivirus – exemple Barley stripe mosaic virus

Genre Idaeovirus – exemple Raspberry bushy dwarf virus

Genre Machlomovirus – exemple Maize chlorotic mottle virus

Genre Ourmiavirus – exemple Ourmia melon virus

Genre Pecluvirus – exemple Peanut clump virus

Genre Pomovirus – exemple Potato mop-top virus

Genre Sadwavirus – exemple Satsuma dwarf virus

Genre Sobemovirus – exemple Southern bean mosaic virus

Genre Tobamovirus – exemple virus de la mosaïque du tabac

Genre Tobravirus – exemple Tobacco rattle virus

Genre Umbravirus – exemple Carrot mottle virus

Orde picornavirales

¨  Familie picornaviridae

   

¨  Famille des Dicistroviridae

   
   

¨  FamilIe flaviridae

   

¨  FamilIe Marnaviridae

¨  familie Incertae sedis ( nog niet gerangschikt)

   

Groep V- RNA virus enkelvoudige streng met negatieve polariteit

¨  Orde Mononegavirales

(virus à polarité négative non-segmentés)

¨  FamilIe bornaviridae

   

¨  Famille des Filoviridae

   

¨  Familie paramyxoviridae

   

¨  Familie rhabdoviridae

 

 

¨  familie arenaviridae

exemples virus de la fièvre de Lassa, virus Junin (fièvres d'Amérique du Sud)

   

¨  Familie bunyaviridae

   

¨  famille des orthomyxoviridae
virus de l'influenza a, b, c, d (griepvirus, virus de la grippe)

 

 

Genres non classés

Genre Deltavirus – exemple virus de l'Hépatite delta

Genre Ophiovirus – exemple Citrus psorosis virus

Genre Tenuivirus – exemple Rice stripe virus

Genre Varicosaivirus – exemple Lettuce big-vein associated virus

Groep VI – RNA virus retrovirus  enkelvoudige streng

virus à adn ou à arn à transcription inverse

¨  Famille Metaviridae

¨  Famille Pseudoviridae

¨  Familie Retroviridae

   

Groep VII – DNA virus retrovirus met dubbele streng

¨  Famille Hepadnaviridae

   

 

 

DOMEIN PRIONEN

   

DOMEIN PROTISTA, PROTOZOA

Protozoa zijn polyphyletisch, met andere woorden, deze groep vertegenwoordigd geen groep met een gemeenschappelijke voorouder. Deze benaming wordt dus niet meer gebruikt in de moderne taxonomie.

Rhodophyta (algues rouges)

Chromista

Stramenopiles (Heterokonta)

Haptophyta

Cryptophyta

Alveolata

Dinophyta (dinoflagellés)

Apicomplexa (apicomplexés)

Ciliophora (ciliés)

Excavata

Euglenozoa

Percolozoa

Metamonada

Rhizaria

Radiolaria

Foraminifera

Cercozoa

Amoebozoa

Opisthokonta

Choanobionta

Choanoflagellata (choanoflagellés

phylum percolozoa

Orde schizophrenida

¨  Familie vahlkampfiidae

   

phylum dinoflagellata

Orde blastodiniales

¨  Familie oodiniaceae

   

Phylum flagellata

Orde bodonida

¨  Familie bodonidae

   

phylum cnidaria

Orde bivalvulida

¨  Familie myxobolidae

   

phylum apicomplexa

orde eucoccidiorida

¨  familie hepatozoïdae

   

orde achromatorida

¨  familie leucocytozoïdae

   

orde Haemosporida

¨  familie haemoproteidae

   

orde piroplasmida

¨  familie babesiidae

   

¨  familie incertae sedis

   

¨  familie theileriidae

   

Phylum microsporidia

Orde microsporida

¨  Familie glugeidae

   

phylum euglenozoa

klasse kinetoplastea

Orde kinetoplastida

¨  Familie cryptobiidae

   

Orde trypanosomatida

¨  Familie trypanosomatidae

   

phylum amoebozoa, rhizopoda

klasse Lobosea

orde amoebida

¨  familie entamoebidae

   

¨  familie amoebidae

   

Phylum ciliophora

orde incertae sedis

¨  familie INCERTAE SEDIS

   

Orde peritrichida

¨  Familie trichodinidae

   

Orde hymenostomatida

¨  Familie ichthyophtiriidae

   

Orde trichomonadida

¨  Familie trichomonadidae

   

Orde eimeriida

¨  Familie eimeriidae

   

Orde diplomonadida

¨  Familie hexamitidae

   

Orde cyrtophorida

¨  Familie chilodonellidae

   

Orde mobilida

¨  Familie trichodinidae

   

Orde eucoccidiorida

¨  Familie sarcocystidae

   

Orde dysteriida

¨  Familie hartmannulidae

   

NIET BIOLOGISCHE OORZAKEN

cfr syndromen/ algemene en metabole stoornissen

oorzaak allergenen

allergenen

oorzaak alimentair

plethora: overdaad

voedselgebrek

Vitaminetekort

Mineralen en oligoelemententekort

andere: onaangepaste voeding (cfr ook voedselintoxicatie)

voedseladditiva

oorzaak intoxicatie

Intoxicatie: algemeen

   

Anorganische giften

Organische giften   

Lagere planten, schimmels, zwammen  myc

mycotoxines

Planten  bot

Dierlijke toxines  ani

huishoudelijke produkten        

hallucinogenen (empathogenen)

   
   

Voedselintoxicatie

   

milieucontaminanten

oorzaak iatrogeen, -nosocomiaal, -pharmacologisch

algemeen iatrogene aandoeningen  gen

nosocomiale infecties  nos

medicamenteuse nevenwerkingen  pha

Classificatie geneesmiddelen:

1.1Analgésiques et Anti-inflammatoires

1.2Antibiotiques et Antibactériens

1.3Antituberculeux et Antilépreux

1.4Antimycosiques

1.5Antiviraux

1.6Cardiologie

1.7Dermatologie

1.8Diététique et Nutrition

1.9Endocrinologie

1.10Gastro-entérologie et hépatologie

1.11Gynécologie obstétrique et contraception

1.12Hématologie

1.13Immunologie Allergologie

1.14Médicaments des troubles métaboliques

1.15Neurologie

1.16Ophtalmologie

1.17Oto-rhino-laryngologie

1.18Parasitologie

1.19Pneumologie

1.20Psychiatrie

1.21Réanimation toxicologie

1.22Rhumatologie

1.23Stomatologie

1.24Urologie

1.25Vaccins, immunoglobulines, sérothérapie

1.26Cancérologie

1.27Anesthésiques locaux

¨  rhumatologie

¨  uricemie

¨  alcaloïden

¨  Antiparasitaire middelen

¨  cardiologie

¨  Antiepileptica

¨  anesthetica

¨  diuretica

¨  hormonen, endocrinologie

¨  niet steroïde ontstekingsremmers NSAID

¨  Gynecologie - andrologie

¨  antibiotica

¨  Chimiotherapie, oncologie

oorzaak erfelijke en congenitale aandoeningen 

erfelijk

oorzaak fysische factoren (physinoses)

Licht  lux

Temperatuur  tem    

Relatieve vochtigheid  hum

Zuurtegraad  -pH

Druk  bar

Radioactiviteit  rad

Electriciteit  ele

oorzaak: Problemen van dierwelzijn 

Animal welfare

oorzaak milieu, lucht vervuiling

ecologie 

oorzaak traumatisch-mechanisch  trm

trauma

oorzaak idiopatisch-ongekende oorzaak  idi

idiopatisch