ETIOLOGIE
CLADE PLANTEN
phylum chlorophyta groenwieren
klasse trebouxiophyceae
orde chlorellales
¨ familie chlorellaceae
CLADE DIEREN
phylum arthropoda
klasse insecta
Orde phtyraptera (luizen)
¨ familie philopteridae, bijtende luizen
¨ familie gyropidae(suborder, bijtende luizen
|
|
¨ familie trimenoponidae, bijtende luizen
|
|
¨ Familie gyropidae, bijtende luizen
|
|
¨ familie trichodectidae, bijtende luizen
|
|
|
|
|
|
|
|
|
¨ familie phtiridae, steek en zuigluizen
|
|
¨ familie hematopinidae, steek en zuigluizen
|
|
|
|
|
|
Orde hemiptera (halfvleugeligen)
¨ Familie cimicidae (wantsen)
¨ familie reduviidae
Orde diptera
¨ familie tabanidae
¨ familie muscidae
¨ familie braulidae
¨ familie scathophagidae
|
|
¨ familie calliphoridae
|
|
¨ familie glossinidae
¨ familie hippoboscidae
|
|
¨ familie oestridae (horzels)
|
|
|||
¨ Familie simuliidae (kriebelmuggen)
¨ familie culicidae (muggen)
¨ Familie ceratopogonidae (zandvliegen)
|
|
¨ Familie psychodidae (motmuggen)
orde hymenoptera (vliesvleugeligen)
¨ Familie vespidae
|
|
Orde siphonaptera (vlooien)
¨ Familie pulicidae
orde lepidoptera
¨ Familie notodontideae
orde coleoptera
¨ Familie Nitidulidae
KLASSE ARACHNIDA (SPINNEN)
|
|
KLASSE ACARI (MIJTEN)
Orde astigmata
¨ Familie falculiferidae
|
|
¨ Familie analgidae
¨ Familie dermoglyphidae
Orde mesostigmata
¨ Familie dermanyssidae
¨ Familie rhinonyssidae
¨ Familie Laelapidae
¨ Familie varroidae
|
|
|
|
|
Orde thrombidiformes
¨ Familie tarsonemidae
¨ Familie thrombiculidae
¨ familie cheyletidae
Orde sarcoptiformes
¨ familie psoroptidae
¨ Familie sarcoptidae
¨ familie acaridae
Orde ixodidae (teken)
¨ Familie argasidae
|
|
¨ Familie ixodidae
Orde prostigmata
¨ Familie demodicidae
KLASSE CRUSTACEA
Orde cyclopoida (copepoda)
¨ Familie lernaeidae
Orde arguloïda
¨ Familie argulidae
Orde porocephalida
¨ Familie linguatulidae
phylum annelida
Orde rhynchobdellinda
¨ Familie piscicolidae
phylum nematoda
Orde ascaridida
¨ Familie toxocaridae
¨ Familie ascarididae
¨ Familie oxyuridae
¨ Familie toxocaridae
¨ Familie dioctophymatidae
Orde spirurida
¨ familie filariidae
¨ familie onchocercidae
¨ familie spiruridae
¨ Famillie thelaziidae
|
|
¨ Familie camallanidae
¨ Familie habronematidae
Orde strongylida
¨ Familie dictyocaulidae
|
|
|
¨ Familie metastrongylidae
¨ Familie trichostrongylidae
|
|
|
|
|
¨ Familie ankylostomatidae
|
|
¨ Familie strongylidae
¨ Familie strongyloïdae
¨ Familie syngamidae
¨ Familie protostrongylidae
Orde trichocephalida
¨ Familie capillariidae
¨ Familie trichuridae
orde camallanida
¨ familie dracunculidae
phylum plathelminthes
klasse cestoda
orde pseudophyllidea
¨ familie diphyllobothriideae
Orde cyclophyllidae
¨ Familie taeniidae
¨ familie mesocestoïdeae
¨ familie hymenolepididae
¨ familie anoplocephalidae
Klasse trematoda
orde strigeatida
¨ familie schistosomatidae
Orde monopisthocotylea
¨ Familie gyrodactylidae
¨ Familie dactylogyridae
Orde echinostomida
¨ Familie fasciolidae
¨ familie paramphistomatidae
Orde plagiorchiida
¨ Familie dicrocoeliidae
|
|
Klasse turbellaria
|
|
phylum chordata
klasse sauropsida
Orde squamata - serpentes
|
Systematiek: domein: procaryota – rijk: bacteria |
CLADE BACTERIEN
Phylum Acidobacteria
Class Acidobacteria
Acidobacteriales Cavalier-Smith 2002
Class Holophagae
Acanthopleuribacterales Fukunaga et al. 2008
Holophagales Fukunaga et al. 2008
Class Solibacteres
"Solibacterales"
"Bryobacterales"
Phylum Actinobacteria
Class Acidimicrobiia
Acidimicrobiales Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
Class Actinobacteria
Acidothermales Sen et al. 2014
"Catenulisporales" Donadio et al 2012
"Streptomycetales" Kampfer 2012
Geodermatophilales Sen et al. 2014
Frankiales Sen et al. 2014
Nakamurellales Sen et al. 2014
"Kineosporiales" Kampfer 2012
orde micrococcales [Actinomycetales; Bifidobacteriales; Arthrobacteria]
¨ Familie Bifidobacteriaceae
Genres Aeriscardovia, Bifidobacterium, Gardnerella et Parascardovia
¨ Familie Actinomycetaceae
¨ Genus Actinobaculum
¨ Genus Actinomyces
|
|
¨ Genus trueperella (Arcanobacterium)
|
|
¨ Famille des Microbacteriaceae
Genres Microbacterium et Rathayibacter
¨ familie micrococcaceae
Genres Arthrobacter, Micrococcus, Renibacterium, Rothia, Stomatococcus
¨ GENUS MICROCOCCUS
¨ Famille des Dermatophilaceae
¨ GenUS Dermatophilus
¨ familie corynebacteriaceae
¨ genus corynebacterium: Gram + staaf met gezwollen uiteinde
¨ familie mycobacteriaceae
¨ genus mycobacterium; zuurresistente kiemen
|
|
¨ Famillie nocardiaceae
¨ Genus Rhodococcus
orde Propionibacteriales" Patrick & McDowell 2012
¨ Famille des Propionibacteriaceae
¨ Genus Propionibacterium
"Streptosporangiales" Goodfellow 2012
"Jiangellales" Tang et al. 2012
"Glycomycetales" Labeda 2012
"Micromonosporales" Genilloud 2012 [Actinoplanales]
"Pseudonocardiales" Labeda & Goodfellow 2012
"Corynebacteriales" Goodfellow & Jones 2012 [Mycobacteria]
Class Coriobacteriia
Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
Eggerthellales Gupta et al. 2013
Class Nitriliruptoria
Egibacterales Zhang et al. 2015
Egicoccales Zhang et al. 2015
Euzebyales Kurahashi et al. 2010
Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009
Class Rubrobacteria
Rubrobacterales Rainey et al. 1997
Class Thermoleophilia
Gaiellales Albuquerque et al. 2012
Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009
Phylum Aquificae[edit]
Class Aquificae
Aquificales Reysenbach 2002 emend. Gupta & Lali 2013
Desulfurobacteriales Gupta & Lali 2014
Phylum Armatimonadetes[edit]
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Armatimonadetes.
Class Armatimonadia
Armatimonadales Tamaki et al. 2011
Class Chthonomonadetes
Chthonomonadales Lee et al. 2011
Class Fimbriimonadia
Fimbriimonadales Im et al. 2012
Phylum Bacteroidetes
Class Bacteroidia
Ordre des Bacteroidales Krieg 2012
¨ Familie Bacteroidaceae
¨ Genus Bacteroides
|
|
¨ Familie Porphyromonadaceae
Genre Porphyromonas
Class Balneolia
Balneolales Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016
Class Chitinophagia
"Chitinophagales" Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016
Class Cytophagia
Cytophagales Leadbetter 1974
Class Flavobacteriia
Orde Flavobacteriales Bernardet 2012
¨ Familie Flavobacteriaceae
Genus Arenibacter, Bergeyella, Bizonia, Capnocytophaga, Chryseobacterium, Coenonia, Elizabethkingia, Flavobacterium, Leeuwenhoekiella, Ornithobacterium, Riemerella, Salegentibacter, Tenacibaculum et Weeksella. Gram negatieve bacteriën
|
|
Class Rhodothermia
Rhodothermales Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016
Class Sphingobacteriia
Sphingobacteriales Kämpfer 2012
Phylum Chlamydiae
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chlamydiae.
Class Chlamydiae
Orde Chlamydiales Storz & Page 1971 emend. Everett et al. 1999
Orde chlamydiales
¨ Familie Chlamydiaceae
¨ Genus Chlamydia
|
|
|
¨ Genus Chlamydiophila
deze classificatie in twee genera: chlamydia en chlamydiophyla werd recent verlaten, en werd enkel het genus chlamydia weerhouden. (532)
Phylum Chlorobi
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chlorobi.
Class Chlorobia
Chlorobiales Gibbons & Murray 1978
Class Ignavibacteria
Ignavibacteriales Iino et al. 2010
Phylum Chloroflexi
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chloroflexi.
Class Anaerolineae
Anaerolineales Yamada et al. 2006
Class Ardenticatenia
Ardenticatenales Kawaichi et al. 2013
Class Caldilineae
Caldilineales Yamada et al. 2006
Class Chloroflexia
Chloroflexales Gupta et al. 2013
Herpetosiphonales Gupta et al. 2013
Kallotenuales Cole et al. 2013
Class Dehalococcoidia
Dehalococcoidales Löffler et al. 2013
Class Ktedobacteria
Ktedobacterales corrig. Cavaletti et al. 2007 emend. Yabe et al. 2010
Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011
Class Thermomicrobia
Sphaerobacterales Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
Thermomicrobiales Garrity & Holt 2002
Class Thermoflexia
Thermoflexales Dodsworth et al. 2014
Phylum Chrysiogenetes
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Chrysiogenetes.
Class Chrysiogenetes
Chrysiogenales Garrity & Holt 2002
Phylum Cyanobacteria
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Cyanobacteria.
Class Gloeobacteria
Gloeobacterales Cavalier-Smith 2002
Class Phycobacteria
Chroococcidiopsidales
Chroococcales Cavalier-Smith 2002
Nostocales [Stigonematales]
Oscillatoriales
Pleurocapsales
Pseudanabenales
Spirulinales
Synechococcales
Phylum Deferribacteres
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Deferribacteres.
Class Deferribacteres
Deferribacterales Huber & Stetter 2002
Phylum Deinococcus-Thermus
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Deinococcus-Thermus.
Class Deinococci
Deinococcales Rainey et al. 1997 (radio-resistant micrococci)
Thermales Rainey & da Costa 2002
Phylum Dictyoglomi
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Dictyoglomi.
Class Dictyoglomi
Dictyoglomales Patel 2012
Phylum Elusimicrobia
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Elusimicrobia.
Class "Blastocatellia"
"Blastocatellales" Pascual et al. 2015
Class Elusimicrobia
Elusimicrobiales Geissinger et al. 2010
Class "Endomicrobia"
"Endomicrobiales" Zheng et al. 2016
Phylum Fibrobacteres
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Fibrobacteres.
Class "Chitinispirillia"
"Chitinispirillales" Sorokin et al. 2016
Class Chitinivibrionia
Chitinivibrionales Sorokin et al. 2014
Class Fibrobacteres
"Fibromonadales" Abdul Rahman et al. 2016
Fibrobacterales Spain et al. 2012
Phylum Firmicutes
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Firmicutes.
Class Erysipelotrichia
Eggerthiales
Erysipelotrichales Ludwig et al. 2010
Class Negativicutes
Selenomonadales Marchandin et al. 2010
Class Thermolithobacteria
Thermolithobacterales
Class Tissierellia
Tissierelliales
Class Bacilli
Orde Bacillales
ORDE BACILLALES
¨ Familie Bacillaceae
¨ Genus Bacillus
¨ Familie paenibacIllaceae
¨ Familie Listeriaceae
¨ Familie staphylococcaceae
Genus Gemella, Jeotgalicoccus, Macrococcus et Staphylococcus
¨ Genus staphylococcus
Haloplasmatales
Lactobacillales Ludwig et al. 2010
ORDE LACTOBACILLIALES
¨ Familie Aerococcaceae
Genres Abiotrophia, Aerococcus, Allofustis, Dolosicoccus, Eremococcus, Facklamia, Globicatella et Ignavigranum
¨ Familie Enterococcaceae
Genres Atopobacter, Enterococcus, Melissococcus et Vagococcus
¨ FamilIe Lactobacillaceae
Genre Lactobacillus
¨ FamilIe Leuconostocaceae
Genres Leuconostoc et Weissella
¨ FamiIle Streptococcaceae
Genres Lactococcus et Streptococcus
Class Clostridia
ORDE CLOSTRIDIALES
¨ Familie Clostridiaceae
Genus fecalibacterium
Genus hespellia
Genus guggenheimella
Genus sarcina
¨ Familie Eubacteriaceae
Genus Eubacterium
Orde Halanaerobiales Rainey and Zhilina 1995
Natranaerobiales
Thermoanaerobacteriales Wiegel 2010
Class Mollicutes
Acholeplasmatales
Anaeroplasmatales
ORDE ANAEROPLASMATALES
¨ Famille des Erysipelotrichaceae
¨ Genus Erysipelothrix
Orde Entomoplasmatales Tully et al. 1993
ORDE MYCOPLASMATALES
¨ Familie Mycoplasmataceae
Genus Eperythrozoon, Haemobartonella, Mycoplasma et Ureaplasma
|
Synoniem pleuropneumonia like organisms, PPLO/ Ultrafiltreerbare organismen (100-200nm) bestaande uit RNA en DNA, kunnen in milieukcultuur gekweekt worden |
Phylum Fusobacteria
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Fusobacteria.
Class Fusobacteria
Fusobacterales
ORDE FUSOBACTERIALES
Staley & Whitman 2012
¨ Famillie fusobacteriaceae
¨ Genus : Fusobacterium en Streptobacillus
Phylum Gemmatimonadetes
Class Gemmatimonadetes
Gemmatimonadales Zhang et al. 2003
Class Longimicrobia
Longimicrobiales Pascual et al. 2016
Phylum Lentisphaerae
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Lentisphaerae.
Class Lentisphaeria
Lentisphaerales Cho et al. 2004 emend. Choi et al. 2013
Victivallales Cho et al. 2004
Class Oligosphaeria
Oligosphaerales Qiu et al. 2013
Phylum Nitrospirae
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Nitrospirae.
Class Nitrospiria
"Nitrospirales"
Phylum Planctomycetes
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Planctomycetes.
Class Phycisphaerae
Phycisphaerales Fukunaga et al. 2010
Tepidisphaerales Kovaleva et al. 2015
Class "Planctomycetia"
"Brocadiales" Jetten et al. 2011
Planctomycetales Schlesner & Stackebrandt 1987 emend. Ward 2011
Phylum Proteobacteria
klasse alfaproteobacteria
Orde Caulobacterales
Orde Holosporales
Orde "Kopriimonadales" Kwon et al. 2005c
Orde Kordiimonadales Kwon et al. 2005
Orde Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
Orde "Pelagibacterales" Grote et al. 2012
ORDE DER RHIZOBIALES
|
Systematiek: stam: proteobacteria - klasse: alfa proteobacteria |
¨ FAMILIE BARTONELLACEAE
¨ GENUS BARTONELLA
¨ Familie Brucellaceae
¨ Genus Ochrobacterium
¨ Genus Brucella
Orde Rhodobacterales [Parvularculales]
Orde Rhodospirillales
Orde Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014
ORDE RICKETTSIALES
¨ Familie rickettsiaceae
¨ Genus orienta, rickettsia, chlamydia
¨ Familie anaplasmataceae
genus Anaplasma, Aegyptianella, Cowdria, Ehrlichia, Neorickettsia et Wolbachia
¨ genus ehrlichia
¨ Genus anaplasma
|
|
¨ Genus cowdria
¨ Genus aegyptianella
Orde Sphingomonadales
Orde Sneathiellales
klasse Betaproteobacteria
ORDE BURKHOLDERIALES
¨ Famillie Alcaligenaceae
Genus Alcaligenes, Bordetella, Brackiella, Pelistega, Sutterella,Taylorella
Orde "Ferritrophicales" Weiss et al. 2007
Orde "Ferrovales" Johnson, Hallberg & Hedrich 2014
Orde "Gallionellales" Weiss et al. 2007 (iron bacteria)
Orde Hydrogenophilales Garrity, Bell & Lilburn 2006
Orde Methylophilales Garrity, Bell & Lilburn 2006
Ordre des Neisseriales
¨ Famille des Neisseriaceae
Genres Chromobacterium, Laribacter, Neisseria et Uruburuella
NEISSERIA: diplokokken
Orde Nitrosomonadales
Orde Procabacteriales Garrity, Bell & Lilburn 2003
Orde Rhodocyclales Garrity, Bell & Lilburn 2006
Orde Sulfuricellales Watanabe, Kojima & Fukui 2015
klasse gammaproteobacteria
Orde Acidiferrobacterales Kojima, Shinohara & Fukui 2015
Orde Acidithiobacillales
Orde aeromonadales
¨ Famillie aeromonadaceae
Genus Aeromonas
Orde Alteromonadales
Orde Arenicellales Teramoto, Yagyu & Nishijima 2015
ORDE CARDIOBACTERIALES
Garrity, Bell & Lilburn
¨ FAMILIE CARDIOBACTERIACEAE
¨ GENUS DICHELOBACTER
Orde Cellvibrionales Spring et al. 2015
Orde Chromatiales
Orde enterobacteriales
¨ Familie enterobacteriaceae
Gram negatieve kiemen. Genus : Buttiauxella, Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Escherichia, Hafnia, Klebsiella (incluant le genre Calymmatobacterium), Moellerella, Morganella, Plesiomonas, Proteus, Providencia, Raoultella, Salmonella, Serratia, Shigella, Trabulsiella et Yersinia.
¨ Genus edwardsiella
|
|
¨ Genus escherichia
¨ Genus salmonella
¨ GENUS SHIGELLA
¨ GENUS PROTEUS
¨ GENUS YERSINIA
¨ GENUS KLEBSIELLA
|
Gram – diplobacil |
ORDE LEGIONELLALES
¨ familie legionellaceae
¨ genus legionella
¨ Familie Coxiellaceae
|
Genus Coxiella is een gram negatieve kiem |
|
Orde Methylococcales
Orde Oceanospirillales
Orde Orbales Kwong & Moran 2013
ORDE PASTEURELLALES
¨ Familie pasteurellaceae
Genus : Actinobacillus, Avibacterium, Gallibacterium, Haemophilus, Histophilus, Lonepinella, Mannheimia, Nicoletella, Pasteurella, Phocoenobacter et Volucribacter
Genus pasteurella
|
|
¨ Genus avibacterium
¨ genus actinobacillus«
¨ Genus haemophilus
ORDE PSEUDOMONADALES
¨ Famillie Pseudomonadaceae
¨ GENUS PSEUDOMONAS
|
|
|
¨ Famillie Moraxellaceae
|
|
¨ Genus Acinetobacter
|
|
¨ Genus Moraxella
¨ Genre Marinomonas
¨ Genus Psychrobacter
Orde Salinisphaerales
ORDE THIOTRICHALES
¨ FAMILIE FRANCISELLACEAE
¨ Genus FRANCISELLA
ORDE VIBRIONALES
¨ Famillie Vibrionaceae
Genus Enterovibrio, Grimontia, Photobacterium et Vibrio
ORDE DER XANTOMONADALES
¨ Familie Xanthomonadaceae
Genus Schineria et Stenotrophomonas
klasse Deltaproteobacteria
Orde Bdellovibrionales
Orde Bradymonadales Wang et al. 2015
Orde Desulfarculales
Orde Desulfobacterales
ORDE DESULFOVIBRIONALES
¨ Familie der desulfovibrionaceae
¨ Genus lawsonia
Orde Desulfurellales
Orde Desulfuromonadales
Orde Myxococcales (fruiting gliding bacteria)
Orde Oligoflexales Nakai et al. 2014
Orde Syntrophobacterales
klasse Epsilonproteobacteria
Orde Campylobacterales
Ordre des Campylobacterales
¨ Famille des Campylobacteraceae
Genus Arcobacter en Campylobacter
¨ Famillie Helicobacteraceae
¨ Genus Helicobacter:soortspecifiek en orgaanspecifiek (maag)
Orde Nautiliales
Phylum "Spirochaetia"
Class Spirochaetes[edit]
Orde Brachyspirales corrig. Gupta et al. 2014
Orde Brevinematales Gupta et al. 2014
Orde Leptospirales Gupta et al. 2014
ORDE SPIROCHETALES Buchanan 1917 emend. Gupta et al. 2013
¨ Familie Spirochaetaceae
Genus Borrelia, Brevinema, Spirochaeta et Treponema
¨ genus Borrelia
¨ Genus treponema
¨ Familie Serpulinaceae
¨ Genus Brachyspira
|
|
¨ Familie Leptospiraceae
¨ Genus Leptospira
Phylum Synergistetes
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Synergistetes.
Class Synergistia
Synergistales Jumas-Bilak et al. 2009
Phylum Thermodesulfobacteria
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Thermodesulfobacteria.
Class Thermodesulfobacteria
Thermodesulfobacteriales Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
Phylum Thermotogae
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Thermotogae.
Class Thermotogae
Kosmotogales Bhandari & Gupta 2014
"Mesoaciditogales
Petrotogales Bhandari & Gupta 2014
Thermotogales Reysenbach 2002 emend. Bhandari & Gupta 2014
Phylum Verrucomicrobia
This section lists the orders of Bacteria within the phylum Verrucomicrobia.
"Methylacidiphilales" Op den Camp 2009
Class "Spartobacteria"
"Chthoniobacterales" Sangwan et al. 2004
"Xiphinematobacterales"
Class Opitutae
Opitutales Choo et al. 2007
Puniceicoccales Choo et al. 2007
Class Verrucomicrobiae
Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 emend. Yoon et al. 2008
List of Candidate Phyla[edit]
"Gracilibacteria" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum GN02)
"Saccharibacteria" Albertsen et al. 2013 (Candidate phylum TM7)
"Microgenomates" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP11)
"Parcubacteria" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OD1)
"Aegiribacteria" Hamilton et al. 2016
"Kryptonia" Castelle 2013
"Zixibacteria" Castelle 2013
"Cloacimonetes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum WWE1)
"Latescibacteria" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum WS3)
"Marinimicrobia" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum SAR406; candidate phylum Marine Group A)
"Omnitrophica" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP3)
"Aminicenantes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP8)
"Calescamantes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum EM19)
"Atribacteria" Dodsworth et al. 2013 (Candidate phylum OP9)
"Hydrogenedentes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum NKB19)
"Poribacteria" Fiesler et al. 2004
"Aerophobetes" Rinke et al. 2013 (Candidate phylum CD12; BHI80-139)
"Abawacabacteria" Anantharaman et al. 2016
"Berkelbacteria" Wrighton et al. 2014 (Candidate phylum ACD58)
"Caldiserica" Mori et al. 2009
Acetothermia Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OP1)
Endoecteinascidia
Tectomicrobia Wilson et al. 2014
Fervidibacteria Rinke et al. 2013 (Candidate phylum OctSpa1-106)
"Peregrinibacteria" Brown et al. 2015 (Candidate phylum PER)
"Coatesbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Dadabacteria" Hug et al. 2016
"Deinonema" Ludwig W et al. 1990
"Delongbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Desantisbacteria" Probst et al. 2016
"Doudnabacteria" Anantharaman et al. 2016
"Edwardsbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Eisenbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Firestonebacteria" Anantharaman et al. 2016
"Fischerbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Fraserbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Glassbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Handelsmanbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Kapabacteria" Kantor et al. 2015
"Lindowbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Margulisbacteria" Anantharaman et al. 2016
Modulibacteria (Candidate phylum KSB3)
"Nitrospinae" Lucker et al. 2013
"Raymondbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Riflebacteria" Anantharaman et al. 2016
"Rokubacteria" Hug et al. 2016
"Schekmanbacteria" Anantharaman et al. 2016
Dependentiae Yeoh et al. 2016 (Candidate phylum TM6)
"Wallbacteria" Anantharaman et al. 2016
"Wirthbacteria" Hug et al. 2016
DOMEIN FUNGI (MYCOSES) myc
Phylum Microsporidia
Orde apansporoblastina
¨ Fam unicaryonidae
¨ Genus encephalitozoon
Orde Dissociodihaplophasida
¨ Familie nosematidae
Phylum Chytridiomycota
espèces aquatiques dont les spores portent un flagelle. On les considère comme les ancêtres de tous les autres champignons.
Klasse Chytridiomycetes
ORDE CHYTRIDIALES
¨ Genus Chytridium
ORDE RHIZOPYDIALES
¨ Genus Batrachochytrium
Phylum Ascomycota
les spores sont produites à l'intérieur de sacs (les asques) et sont projetées, à maturité, à l'extérieur par ouverture de l'asque.
klasse dothideomycetes
orde pleosporales
¨ familie pleosporaceae
orde capnodiales
¨ familie davidiellaceae
|
|
klasse leoteomycetes
orde heliotales
¨ familie myxotrichaceae
Klasse Ascomycetes
orde incertae sedis
Orde onygenales
¨ Familie Onygenaceae
¨ Genus Histoplasma
Klasse Eurotiomycetes
orde onygenales
¨ familie onygenaceae
¨ Genus coccidioïdes
¨ familie ajellomycetaceae
¨ familie arthrodermataceae
|
|
Orde ASCOSPHAERALES
¨ Familie ASCOSPHAERACEAE
¨ Genus asCOSPHAERA
orde eurotiales
¨ Familie Trichocomaceae
¨ Genus aspergillus
¨ genus penicillium
klasse sordariomycetes
orde microascales
orde ophiostomatales
¨ familie ophiostomataceae
orde Hypocreales
¨ familie nectriaceae
¨ familie clavicipitaceae
Klasse Saccharomycetes
Orde saccharomycetales
¨ Familie saccharomycetaceae
¨ Genus candida
klasse incertae sedis
orde incertae sedis
¨ familie incertae sedis
Phylum Zygomycota
espèces à spores non flagellées dont les cellules ne sont pas séparées par des cloisons.
klasse zygomycetes
Orde mucorales
¨ Familie mucoraceae
¨ Genus mucor
|
|
Phylum Basidiomycota
les spores se développent à l'extrémité de cellules spécialisées (les basides) et sont dispersées par le vent à maturité.
orde malasseziales
¨ familie malasseziaceae
orde corticiales
¨ familie corticiaceae
Klasse Urediniomycetes
Orde sporidiales
¨ Familie Sporidiobolaceae
¨ Genus Cryptococcus (Filobasidiella)
Phylum oomycota
Klasse oomycetes
Orde saprolegniales
¨ Familie saprolegniaceae
¨ Familie leptolegniaceae
phylum choanozoa
deze kiemen situeren zich op de grens tussen dier en fungi
klasse ichthyosporea
orde dermocystida
Phylum Glomeromycota
autrefois classés dans les Zycomycota ils sont maintenant considérés comme constituant une division à part.
nota: de mycotoxines
overschrijden van de maximale norm: fusarium (trichotecene 5ppm, zearaleone 0,5ppm, fumonisine 50ppm); alternaria ( alternarol toxine 2ppm); claviceps purpurea (ergotoxine 2ppm); aspergillus flavus (aflatoxine 20ppm); penicillium (patuline, ochratoxine A, citrinine, paxiline)
DOMEIN VIRUSSEN
virussen
Groep I – DNA virus met dubbele streng
¨ FamilIe Myoviridae – exemple phage T4
¨ FamilIe Podoviridae
¨ FamilIe Siphoviridae
¨ FamilIe Ascoviridae
¨ Familie Adenoviridae
¨ FamilIe Asfiviridae
¨ FamilIe Baculoviridae
¨ FamilIe Corticoviridae
¨ FamilIe Fuselloviridae
¨ FamilIe Guttaviridae
¨ Familie Herpesviridae
¨ Familie iridoviridae
¨ Familie lipothrixviridae
¨ Familie nimaviridae
¨ Familie papovavirus
|
|
|
|
|
|
¨ FamilIe Phycodnaviridae
¨ FamilIe Plasmaviridae
¨ Familie poxviridae
¨ FamilIe Rudiviridae
¨ Famille des Tectiviridae
Genres non classés
Mimivirus – exemple Acanthamoeba polyphaga mimivirus
Groep II - DNA virus met enkelvoudige streng
(Groupe II – Virus à ADN à simple brin)
¨ bactériophageN (NIET GECLASSEERD)
¨ FamilIe Inoviridae
¨ FamilIe Microviridae
¨ niet geclasseerde VirusSEN
¨ FamilIe Geminiviridae
¨ FamilIe Nanoviridae
¨ familie circoviridae
¨ Famille des Parvoviridae
|
|
Genres non classés: Anellovirus – exemple Torque teno virus
Groep III RNA virus dubbele streng
(Groupe III - Virus à ARN à double brin)
¨ Familie Birnaviridae
¨ Familie Chrysoviridae
¨ Familie Cystoviridae
¨ Familie hypoviridae
¨ Familie Partitiviridae
¨ Familie Reoviridae
Rotavirus, orthoreovirus
|
|
¨ FamilIe Totiviridae
- · Genres non classés
- · Endornavirus – exemple Vicia faba endornavirus
Groep IV – RNA virus enkelvoudige streng met positieve polariteit
(Groupe IV – virus à ARN simple brin à polarité positive (Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)
¨ Ordre Nidovirales (Virus "nidifiés")
¨ Familie arteriviridae
¨ Familie coronaviridae
¨ FamilIe Roniviridae
¨ FamilIe Astroviridae
¨ FamilIe Barnaviridae
¨ FamilIe Bromoviridae
¨ Familie caliciviridae
¨ Famille des Closteroviridae
¨ Famille des Comoviridae
¨ Familie flaviviridae
¨ FamilIe Flexiviridae
¨ FamilIe Hepeviridae - exemple virus de l'hépatite E
¨ FamilIe Leviviridae
¨ FamilIe Luteoviridae
¨ FamilIe Narnaviridae - virus à ARN nus
¨ FamilIe Nodaviridae
¨ FamilIe Potyviridae
¨ FamilIe Sequiviridae
¨ FamilIe Tetraviridae
¨ Familie togaviridae
¨ Famille des Tombusviridae
¨ Famille des Tymoviridae
Genres non classés
Genre Benyvirus – exemple Beet necrotic yellow vein virus
Genre Cheravirus – exemple Cherry rasp leaf virus
Genre Furovirus – exemple Soil-borne wheat mosaic virus
Genre Hordeivirus – exemple Barley stripe mosaic virus
Genre Idaeovirus – exemple Raspberry bushy dwarf virus
Genre Machlomovirus – exemple Maize chlorotic mottle virus
Genre Ourmiavirus – exemple Ourmia melon virus
Genre Pecluvirus – exemple Peanut clump virus
Genre Pomovirus – exemple Potato mop-top virus
Genre Sadwavirus – exemple Satsuma dwarf virus
Genre Sobemovirus – exemple Southern bean mosaic virus
Genre Tobamovirus – exemple virus de la mosaïque du tabac
Genre Tobravirus – exemple Tobacco rattle virus
Genre Umbravirus – exemple Carrot mottle virus
Orde picornavirales
¨ Familie picornaviridae
¨ Famille des Dicistroviridae
¨ FamilIe flaviridae
¨ FamilIe Marnaviridae
¨ familie Incertae sedis ( nog niet gerangschikt)
Groep V- RNA virus enkelvoudige streng met negatieve polariteit
¨ Orde Mononegavirales
(virus à polarité négative non-segmentés)
¨ FamilIe bornaviridae
¨ Famille des Filoviridae
¨ Familie paramyxoviridae
¨ Familie rhabdoviridae
|
|
¨ familie arenaviridae
exemples virus de la fièvre de Lassa, virus Junin (fièvres d'Amérique du Sud)
¨ Familie bunyaviridae
¨ famille des orthomyxoviridae
virus de l'influenza a, b, c, d (griepvirus, virus de la grippe)
|
|
Genres non classés
Genre Deltavirus – exemple virus de l'Hépatite delta
Genre Ophiovirus – exemple Citrus psorosis virus
Genre Tenuivirus – exemple Rice stripe virus
Genre Varicosaivirus – exemple Lettuce big-vein associated virus
Groep VI – RNA virus retrovirus enkelvoudige streng
virus à adn ou à arn à transcription inverse
¨ Famille Metaviridae
¨ Famille Pseudoviridae
¨ Familie Retroviridae
Groep VII – DNA virus retrovirus met dubbele streng
¨ Famille Hepadnaviridae
|
|
DOMEIN PRIONEN
DOMEIN PROTISTA, PROTOZOA
Protozoa zijn polyphyletisch, met andere woorden, deze groep vertegenwoordigd geen groep met een gemeenschappelijke voorouder. Deze benaming wordt dus niet meer gebruikt in de moderne taxonomie.
Rhodophyta (algues rouges)
Chromista
Stramenopiles (Heterokonta)
Haptophyta
Cryptophyta
Alveolata
Dinophyta (dinoflagellés)
Apicomplexa (apicomplexés)
Ciliophora (ciliés)
Excavata
Euglenozoa
Percolozoa
Metamonada
Rhizaria
Radiolaria
Foraminifera
Cercozoa
Amoebozoa
Opisthokonta
Choanobionta
Choanoflagellata (choanoflagellés
phylum percolozoa
Orde schizophrenida
¨ Familie vahlkampfiidae
phylum dinoflagellata
Orde blastodiniales
¨ Familie oodiniaceae
Phylum flagellata
Orde bodonida
¨ Familie bodonidae
phylum cnidaria
Orde bivalvulida
¨ Familie myxobolidae
phylum apicomplexa
orde eucoccidiorida
¨ familie hepatozoïdae
orde achromatorida
¨ familie leucocytozoïdae
orde Haemosporida
¨ familie haemoproteidae
orde piroplasmida
¨ familie babesiidae
¨ familie incertae sedis
¨ familie theileriidae
Phylum microsporidia
Orde microsporida
¨ Familie glugeidae
phylum euglenozoa
klasse kinetoplastea
Orde kinetoplastida
¨ Familie cryptobiidae
Orde trypanosomatida
¨ Familie trypanosomatidae
phylum amoebozoa, rhizopoda
klasse Lobosea
orde amoebida
¨ familie entamoebidae
¨ familie amoebidae
Phylum ciliophora
orde incertae sedis
¨ familie INCERTAE SEDIS
Orde peritrichida
¨ Familie trichodinidae
Orde hymenostomatida
¨ Familie ichthyophtiriidae
Orde trichomonadida
¨ Familie trichomonadidae
Orde eimeriida
¨ Familie eimeriidae
Orde diplomonadida
¨ Familie hexamitidae
Orde cyrtophorida
¨ Familie chilodonellidae
Orde mobilida
¨ Familie trichodinidae
Orde eucoccidiorida
¨ Familie sarcocystidae
Orde dysteriida
¨ Familie hartmannulidae
NIET BIOLOGISCHE OORZAKEN
cfr syndromen/ algemene en metabole stoornissen
oorzaak allergenen
allergenen
oorzaak alimentair
plethora: overdaad
voedselgebrek
Vitaminetekort
Mineralen en oligoelemententekort
andere: onaangepaste voeding (cfr ook voedselintoxicatie)
voedseladditiva
oorzaak intoxicatie
Intoxicatie: algemeen
Anorganische giften
Organische giften
Lagere planten, schimmels, zwammen myc
mycotoxines
Planten bot
Dierlijke toxines ani
huishoudelijke produkten
hallucinogenen (empathogenen)
Voedselintoxicatie
milieucontaminanten
oorzaak iatrogeen, -nosocomiaal, -pharmacologisch
algemeen iatrogene aandoeningen gen
nosocomiale infecties nos
medicamenteuse nevenwerkingen pha
Classificatie geneesmiddelen:
1.1Analgésiques et Anti-inflammatoires
1.2Antibiotiques et Antibactériens
1.3Antituberculeux et Antilépreux
1.4Antimycosiques
1.5Antiviraux
1.6Cardiologie
1.7Dermatologie
1.8Diététique et Nutrition
1.9Endocrinologie
1.10Gastro-entérologie et hépatologie
1.11Gynécologie obstétrique et contraception
1.12Hématologie
1.13Immunologie Allergologie
1.14Médicaments des troubles métaboliques
1.15Neurologie
1.16Ophtalmologie
1.17Oto-rhino-laryngologie
1.18Parasitologie
1.19Pneumologie
1.20Psychiatrie
1.21Réanimation toxicologie
1.22Rhumatologie
1.23Stomatologie
1.24Urologie
1.25Vaccins, immunoglobulines, sérothérapie
1.26Cancérologie
1.27Anesthésiques locaux